Сюжет игры сосредоточен вокруг экспериментов по телепортации, получивших название slipgates, которые привели к непредвиденному вторжению на Землю враждебной силы под кодовым названием Quake, которая командует огромной армией монстров. Игрок берет на себя роль солдата (позже получившего название Рейнджер), чья миссия состоит в путешествии через скользящие врата, чтобы найти и уничтожить источник вторжения.